本作搭载了全新的游戏系统，无论在画面还是游戏内容上都有很大的改进。《太空侵略者EX》作为射击类游戏名作的后代于PSP平台复燃！整装待发的侵略者们将再次投入战争之中！
在游戏中的“FEATURE”系统中，按照特定的顺序时成功击落侵略者就可以进入升级FEATURE阶段，成功的完成此阶段就会出现供机体升级的道具，不断地获得各种道具的话，就可以使用强力的激光进行攻击。
当游戏进入ROUND阶段，并且成功地完成此阶段时，就会出现“UFO”供玩家挑战，成果的击落后就可以挑战各种各样的迷你游戏了！
游戏中的“BREAK”状态就是玩家对侵略者进行连击时，得分会逐渐翻倍，当达到一定倍率时，就会进入“BREAK”状态，在游戏中一直保持这个状态击破UFO的话，最终的得分也将会是原来的10倍！